Gdy chłopiec o lwim sercu, który nie panuje nad mocą, staje do walki o tytuł Cesarza Magii, czterech dawno wygnanych magów powraca, aby zniszczyć Królestwo Clover.
Mother Mary to megagwiazda – olśniewająca i niezrównana osobowość sceniczna, a jednocześnie wyczerpana i samotna za kulisami. Przytłoczona wyczekiwanym powrotem na scenę, szuka schronienia u swojego byłego przyjaciela i współpracownika, Sama, projektanta mody, który pomógł ukształtować kultowy styl Mother Mary na początku jej kariery.
Akcja rozgrywa się w roku 2029, w świecie, w którym komputery są wszechobecne. Wraz z ich ekspansją zmieniła się definicja przestępstwa. Teraz najgorszą zbrodnią jest włamywanie się do sieci. Aby temu zapobiec, powołano specjalny oddział Sekcja 9, składający się z cyborgów mających dostęp do sieci z każdego miejsca na Ziemi. "Ghost in the Shell" opowiada o poszukiwaniach przez parę agentów groźnego hakera ukrywającego się pod pseudonimem "Władca marionetek".
Serial przedstawia pracę detektywów działu policji zajmujących się badaniem miejsca zbrodni. Pracownicy tego działu używają najnowszych naukowo-technicznych metod, aby bez problemu rozwikłać najtrudniejsze łamigłówki. Scenariusz serialu powstał na podstawie autentycznych materiałów dowodowych i raportów sporządzonych przez organy ścigania na miejscu zbrodni. Autorzy czerpali inspiracje z autentycznych doświadczeń ekipy kryminologów współpracujących z policją. Serial przedstawia trudną i odpowiedzialną pracę techników policyjnych pracujących w jednym z najlepszych laboratoriów w Las Vegas.