Poznaj historię Optimusa Prime'a i Megatrona, lepiej znanych jako zaprzysięgli wrogowie. Kiedyś byli jednak przyjaciółmi związanymi jak bracia, którzy na zawsze zmienili los Cybertronu.
W otoczonym wysokim murem mieście ostatni ocaleni starają się przetrwać ataki olbrzymów, które od wieków nękają ludzkość. Gdy pewnego razu potwory wdzierają się do miasta, jedną z wielu ofiar jest matka nastoletniego Erena. Chłopak poprzysięga zemstę i wraz z najbliższymi przyjaciółmi, Mikasą i Arminem dołącza do oddziałów obronnych. Kilka lat później młodzi żołnierze kończą szkolenie i właśnie mają dołączyć do jednej z jednostek specjalnych, gdy niespodziewanie olbrzymy ponownie atakują.
Osiem lat temu Cytadela, niezależna agencja szpiegowska, została zniszczona przez nowy syndykat, Mantykorę. Po wymazaniu pamięci, elitarni agenci Mason Kane i Nadia Sinh ledwo uszli z życiem. Osiem lat później były współpracownik Masona, Bernard Orlick, prosi go, by pomógł mu powstrzymać Mantykorę przed stworzeniem nowego porządku świata.
Sonic, Knuckles i Tails ponownie łączą siły przeciwko potężnemu nowemu przeciwnikowi, Shadowowi. Shadow to tajemniczy złoczyńca z mocami niepodobnymi do niczego, z czym mieli do czynienia wcześniej. Drużyna Sonica musi szukać nieprawdopodobnego sojuszu w nadziei na powstrzymanie złoczyńcy i ochronę planety.
Pewnego spokojnego dnia na Ziemi dwie resztki armii Friezy, nazywanych Sorbet i Tagoma, przybywają w poszukiwaniu Smoczych Kul w celu ożywienia Friezy. Udaje im się, a Friez szuka zemsty na Saiyanach.